市政府办公室设下列内设机构：

市政府总值班室、秘书处、综合一处、综合二处、综合三处、综合四处、综合五处、综合六处、综合七处、综合八处、综合九处（太湖综合协调处）、综合十处（财经协调处）、信息新闻处、市政府督查室、政务公开办公室（政策法规处）、组织人事处、行政处（离退休干部处）、联络处。机关党委与组织人事处合署办公。